Seebach wurde seit dem Verlegen der ersten Gleise im Jahre 1865 von drei Eisenbahngesellschaften durchfahren. Es waren dies die Nationalbahn (NB), die Nordostbahn (NOB), und die Schweizerischen Bundesbahnen (SBB). Die NB ging 1878 in der NOB und diese wiederum 1902 in der SBB auf. Seither bedient die SBB Seebach mit einem früher bemannten und seit 2004 unbemannten Bahnhof.
Auf Seebacher Grund befinden sich die Linien Zürich-Ã?rlikon-Seebach-Affoltern, Zürich-Bülach, Zürich-Kloten und Zürich-Flughafen Kloten. Seebach hat nur einen Bahnhof, doch waren schon zweimal neue Haltestellen im Hürst und hinter dem Schärenfeld (Katzenbach) geplant.